قدم عبد الرؤوف بالطبيب مستشار الرئيس اليوم الثلاثاء 4 فيفري 2020 استقالته لرئيس الجمهورية قيس سعيد. وأعلن أن أسباب الاستقالة خاصة بعلاقته برئيس الجمهورية ولا علاقة لها بالشأن المهني.
كما أكّد عبد الرؤوف بالطبيب انه سيحترم واجب التحفظ المحمول عليه دون أن يخوض أو يكشف تفاصيل الاستقالة في تصريحات إعلامية.